ذوب (تحلیل رفتن) قرنیه به دنبال درمان KCN با CXL یک عارضه نسبتاً نادر است. در سال 2011، Labiris و همکارانش یک مورد ذوب (تحلیل رفتن) قرنیه بعد از CXL را برای KCN گزارش کردند. فرد جوانی که تحت CXL بدون عارضه قرار گرفت، دچار ذوب قرنیه (تحلیل رفتن) و descemetocele شد که منجر به سوراخ شدن قرنیه شد.
یکی دیگر از عوارض نادر CXL برای درمان KCN پیشرونده، صاف شدن بیش از حد قرنیه است. همانطور که قبلاً ذکر شد، CXL به طور معمول منجر به کاهش K-Reading می شود، اما صاف شدن بیش از حد ممکن است منجر به نازک شدن قرنیه شود. Kymionis یک مورد صاف شدن بیش از حد قرنیه را پس از درمان KCN پیشرونده با CXL معمولی گزارش کرد (129). در طول پیگیری 5 ساله یک بیمار، او صاف شدن قرنیه (تغییر 11.1 D در معادل کروی) و نازک شدن (از مقدار قبل از عملµm 464 به µm 243) را نشان داد.
