مزیت مهم دیگر ابلیشن با ضخامت اپیتلیال مشخص در TransPRK در درمان قرنیه های نامنظم (مثلاً چشم های پس از کراتوپلاستی، چشم های درمان مجدد و چشم های کراتوکونیک در ارتباط با CXL) دیده می شود. در آخرین دسته از چشم ها، بی نظمی های اپیتلیال معمولاً بسیار کمتر از بی نظمی های استرومایی زمینه ای است.
با این حال، در درمان‌های هدایت‌شده با توپوگرافی یا هدایت‌شده از جبهه موج قرنیه، داده‌های درمان بر اساس توپوگرافی اپیتلیال هستند و زمانی که اپیتلیوم لایه‌برداری می‌شود، از بین می‌روند و سطح استرومایی بسیار آشفته‌تر و اندازه‌گیری نشده‌تری را در معرض دید قرار می‌دهند.
