تغییرات هورمونی در بدن بر پاتوژنز و پیشرفت KC تأثیر می گذارد. بیماری های مرتبط با تیروئید و سایر اختلالات هورمونی را می توان با KC مرتبط دانست. تغییرات هورمونی در دوران بارداری می تواند منجر به تغییرات بیومکانیکی در قرنیه و پیشرفت قوز قرنیه شود. درمان جایگزینی هورمونی با استفاده از استروژن/پروژسترون نیز با KC مرتبط است.
افزایش قابل توجه سطوح دهیدرواپی آندروسترون سولفات (DHEA-S) و کاهش سطح استرون در بزاق بیماران KC مشاهده شده است. هیچ ارتباط مستقیمی بین تغییرات هورمونی و شدت KC وجود ندارد، با این حال استروژن ها در تعدیل بیان سیتوکین های التهابی، از جمله IL-6 و TNF-a در سلول های اپیتلیال قرنیه نقش دارند. از این رو ممکن است سطوح هورمونی ریزمحیط استرومایی مانند عوامل التهابی و سلولی را تعدیل کند.
متابولیسمی که می تواند KC را تحت تاثیر قرار دهد. کمبود ویتامین D که یک هورمون استروئیدی است نیز در برخی مطالعات به دلیل نقش آن به عنوان تعدیل کننده التهابی و پاسخ استرس با افزایش مستعد ابتلا به KC مرتبط است.
